Samstag, 8. August 2015

Morphologie - Morphometrie

Die Evolution hat viele verschiedene morphologische Phänomene hervorgebracht, die wir sehen, messen und vergleichen können. Im folgenden werden Programme vorgestellt, mit denen man entsprechende Daten erzeugen und auswerten kann.

Übersicht

ProgrammFunktionDaten
ShapeErfassung und AuswertungKonturen
LeafAnalyserErfassung und AuswertungKonturen
LaminaErfassungDimensionen, Konturen
MorphoJAuswertungKonturen
Morphomatica?Konturen
Morpheus et al?Konturen
CLICErfassung und AuswertungKonturen

Shape

Iwata, H. & Ukai, Y., 2002. SHAPE: A Computer Program Package for Quantitative Evaluation of Biological Shapes Based on Elliptic Fourier Descriptors. Journal of Heredity, 93(5), pp.384–385.
Available at: http://jhered.oxfordjournals.org/content/93/5/384.short .
  • Es handelt sich hierbei um ein Programm zur Analyse von geschlossenen Konturen.
  • Die im Paper angegebene URL , welche zum Programm Download führen sollte, funktioniert nicht. Über eine Google Suche nach "SHAPE Iwata" gelangt man aber zur derzeitigen Web Seite  auf der man das Programm runter laden kann.

LeafAnalyser

Weight, C., Parnham, D. & Waites, R., 2008. TECHNICAL ADVANCE: LeafAnalyser: a computational method for rapid and large-scale analyses of leaf shape variation. The Plant Journal, 53(3), pp.578–586.
Available at: http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2007.03330.x .
  • Die im Paper angegebene URL , welche zum Programm Download führen sollte, funktioniert nicht. Es hat den Anschein, als wäre die Seite gehackt worden. Man findet das Programm aber bei SourceForge.

Morphomatica

"Morphomatica ist ein benutzerfreundliches Computerprogramm, dass zur morphometrischen Analyse der Konturen von Ostrakodenschalen entworfen wurde. Es wurde im Zeitraum von 2001 – 2007 von J. Linhart, W. Brauneis und W. Neubauer (Universität Salzburg) unter Verwendung der biologischen Grundlagen von Dan. L. Danielopol (Österreichische Akademie der Wissenschaften) entwickelt. Die Version Morphomatica 1.6.1 eignet sich besonders für vergleichende Studien von merkmalsarmen Ostrakodenschalen."

Collection of Landmark for Identification and Characterization (CLIC)


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