Eine umfangreiche auf Java basierte Sammlung von Werkzeugen für die Auswertung von Morphometrischen Daten.
Features
Variation
Principal Component Analysis (PCA) "PCA is a useful tool to display variation within a sample and to characterize the main features of shape variation. If the data contain different subgroups, PCA can be used as an ordination method, but users should be aware that PCA is not optimized to find differences among groups (for that purpose, consider canonical variate analysis)."
Die Evolution hat viele verschiedene morphologische Phänomene hervorgebracht, die wir sehen, messen und vergleichen können. Im folgenden werden Programme vorgestellt, mit denen man entsprechende Daten erzeugen und auswerten kann.
Übersicht
Programm
Funktion
Daten
Shape
Erfassung und Auswertung
Konturen
LeafAnalyser
Erfassung und Auswertung
Konturen
Lamina
Erfassung
Dimensionen, Konturen
MorphoJ
Auswertung
Konturen
Morphomatica
?
Konturen
Morpheus et al
?
Konturen
CLIC
Erfassung und Auswertung
Konturen
Shape
Iwata, H. & Ukai, Y., 2002. SHAPE: A Computer Program Package for Quantitative Evaluation of Biological Shapes Based on Elliptic Fourier Descriptors. Journal of Heredity, 93(5), pp.384–385.
Available at: http://jhered.oxfordjournals.org/content/93/5/384.short .
Es handelt sich hierbei um ein Programm zur Analyse von geschlossenen Konturen.
Die im Paper angegebene URL ,
welche zum Programm Download führen sollte, funktioniert nicht. Über
eine Google Suche nach "SHAPE Iwata" gelangt man aber zur derzeitigen Web Seite auf der man das Programm runter laden kann.
LeafAnalyser
Weight, C., Parnham, D. & Waites, R., 2008. TECHNICAL ADVANCE: LeafAnalyser: a computational method for rapid and large-scale analyses of leaf shape variation. The Plant Journal, 53(3), pp.578–586.
Available at: http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2007.03330.x .
Die im Paper angegebene URL ,
welche zum Programm Download führen sollte, funktioniert nicht. Es hat
den Anschein, als wäre die Seite gehackt worden. Man findet das Programm
aber bei SourceForge.
Morphomatica
"Morphomatica ist ein benutzerfreundliches Computerprogramm, dass zur morphometrischen Analyse der Konturen von Ostrakodenschalen entworfen wurde. Es wurde im Zeitraum von 2001 – 2007 von J. Linhart, W. Brauneis und W. Neubauer (Universität Salzburg) unter Verwendung der biologischen Grundlagen von Dan. L. Danielopol (Österreichische Akademie der Wissenschaften) entwickelt. Die Version Morphomatica 1.6.1 eignet sich besonders für vergleichende Studien von merkmalsarmen Ostrakodenschalen."
